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Nathan Basiliko

Aperçu des travaux:
Microbiologie environnementale; science des sols; écologie des écosystèmes; milieux humides; forêts; changement climatique et environnemental; gestion des ressources naturelles; restauration des écosystèmes.

 

Les microorganismes jouent des rôles vitaux dans les écosystèmes et dans nos travaux, notre groupe examine les communautés microbiennes et les microorganismes des sols et sédiments. Nous nous penchons surtout sur les réactions microbiennes aux changements environnementaux induits par l’homme qui ont des conséquences sur les flux de gaz à effet de serre, la dynamique des nutriments, des polluants et du carbone, ainsi que la durabilité plus large de l’écosystème. Les projets actuels sont effectués dans des milieux appliqués (p. ex., des paysages hébergeant des forêts gérées) en collaboration avec d’importants partenaires de recherche du gouvernement et du secteur privé. Nous explorons également les témoins plus généraux de la diversité microbienne dans les sols, les liens entre la diversité et l’activité de même que la façon dont les différentes communautés microbiennes du sol transforment les tissus végétaux en matière organique du sol, puis décomposent la matière organique en produits minéraux, y compris les gaz à effet de serre. Les sites de recherche sur le terrain couvrent les forêts tempérées et boréales de l’est et du centre du Canada ainsi que les tourbières allant de tempérées à pergélisolées (importantes zones humides avec sols organiques où s’accumule le carbone) en Amérique du Nord et ailleurs. Nous avons élargi nos recherches dernièrement afin d’explorer, en collaboration avec une équipe de génie chimique de la Laurentienne, de nouvelles microalgues dans les milieux industriels (http://www.ongen.ca).

Étudiants et boursiers postdoctoraux actuels (à l’Université Laurentienne)
• Michael Preston, Ph.D. (boursier postdoctoral au Centre pour la vitalité des lacs Vale)
• Kelly Chan-Yam (candidate au doctorat, Écologie boréale, Université Laurentienne)
• James Seward (candidat au doctorat, Écologie boréale, Université Laurentienne)
• Sabrina Desjardins (candidate au doctorat, Génie des ressources naturelles, Université Laurentienne; co-direction avec J Ashley Scott)
• Tom Snyder (candidat à temps partiel à la M.Sc. en biologie, Université Laurentienne)
• Saskia Hart (candidate à la M.Sc. en biologie, Université Laurentienne; codirection avec Lisa Venier, Service canadien des forêts)
• Jonathan Lavigne (candidat à la M.Sc. en biologie, Université Laurentienne; codirection avec Peter Beckett)
• Robyn Rumney (candidate à la M.Sc. en biologie, Université Laurentienne; codirection avec John Gunn)
• Merritt Kennedy (candidate à la M.A.Sc. en génie, Université Laurentienne; codirection avec J Ashley Scott)
• Chantale Robinson (candidate à la M.Sc. en biologie, Université Laurentienne; codirection avec Pascale Roy-Léveillée)

Anciens étudiants (à l’Université Laurentienne et à l’Université de Toronto)
•Adam Kirkwood (MSc 2019, Université Laurentienne; codirection avec Pascale Roy-Léveillée)
•Michelle Dart (MSc 2019, Université Laurentienne)
•Leland Johnston (MSc 2019, Université Laurentienne)
•Dr. Martin Brummell (PDF, Centre pour la vitalité des lacs Vale)
•Dr. Asma Asemaninejad (PDF, Centre pour la vitalité des lacs Vale; co-supervised with Nadia Mykytczuk)
•Adrian Kuchtaruk (NSERC USRA-funded researcher; mémoire de spécialisation, Queens University codirection avec Paul Grogan)
•Chantae Robinson (mémoire de spécialisation, 2019, Université Laurentienne; codirection avec Pascale Roy-Léveillée)
•Heather Patterson (mémoire de spécialisation, 2019, Université Laurentienne; codirection avec Peter Beckett)
•Amy Laframboise (mémoire de spécialisation, 2019, Université Laurentienne)
•Michael Carson (Ph.D. 2018, Université Laurentienne)
•Jesse Hoage (M.Sc. 2018, Université Laurentienne; codirection avec Lisa Venier, Service canadien des forêts)
•Kurt Yakimovich (M.Sc. 2017, Université Laurentienne; codirection avec Nadia Mykytczuk)
•Shanay Williams-Johnson (M.Sc. 2016, Université Laurentienne; codirection avec Nadia Mykytczuk)
•Bryce Robinson (mémoire de spécialisation, 2016, Université Laurentienne)
•Jason Shabaga (Ph.D., 2016, Université de Toronto)
•Genevieve Noyce (Ph.D. 2016, Université de Toronto; codirection avec R. Fulthorpe)
•Carolyn Winsborough (Ph.D. 2015, Université de Toronto)
•Galen Guo (M.Sc. 2015, Université Laurentienne)
•Adam Gorgolewski (MSc-F 2015, Université de Toronto, codirection avec John Caspersen)
•Gurpreet Aulakh (mémoire de spécialisation, 2015, Université Laurentienne)
•Jennifer Pichette (mémoire de spécialisation, 2015, Université Laurentienne)
•Emily Smenderovac (MSc-F 2014, Université de Toronto; codirection avec John Caspersen)
•Michael Preston (Ph.D. 2013, Université de Toronto)
•Michael McTavish (mémoire de spécialisation, 2012, Université de Toronto)
•Stephanie Pugliese (mémoire de spécialisation, 2012, Université de Toronto)
•Darcie McNeill (mémoire de spécialisation, 2012, Université de Toronto)
•Tara Sackett (boursière postdoctorale, 2010-2013, Université de Toronto)
•Varun Gupta (M.Sc. 2011 et mémoire de spécialisation, 2009, Université de Toronto)
•Aaron Godin (mémoire de spécialisation, 2010, Université de Toronto)
•Kristine Haynes (mémoire de spécialisation, 2010, Université de Toronto)
•Phil Rudz (mémoire de spécialisation, 2010, Université de Toronto)
•Cori Armés (M.Sc. 2009, Université de Toronto)
•Britney Myers (mémoire de spécialisation, 2009, Université de Toronto)
•Natalia Voloshchuk (mémoire de spécialisation, 2009, Université de Toronto)
•Carolyn Winsborough (chercheuse d’été, lauréate d’une Bourse de recherche de 1er cycle du CRSNG, Université de Toronto)

Formation et expérience professionnelle:

Professeur et titulaire d’une chaire de recherche du Canada, Université Laurentienne (2013-)
Président élu (2019), président (2020) et président sortant (2021), Société canadienne de la science du sol
Corédacteur, Soil Research (2018-)
Corédacteur, FEMS Microbiology Letters (2015-)
Corédacteur, Canadian Journal of Soil Science (2013-)
Membre du conseil de gouvernance (représentant l’est), Société canadienne de la science du sol (2015-2016)
Professeur adjoint et agrégé (2006-2013), Université de Toronto (campus de Mississauga), Département de géographie
Boursier postdoctoral (2004-2006), Université de la Colombie-Britannique, Département de sciences forestières
Ph.D. (2005), Université McGill, Montréal (Québec), Département de géographie
B.S. (1999), Université Cornell, Ithaca, États-Unis, concentration en ressources naturelles

Publications (Google Scholar) http://scholar.google.ca/citations?user=ed1fimwAAAAJ 

Projets de recherche actuellement financés
The tiny majority: how microbes mediate ecosystem functioning under anthropogenic stressors in boreal environments. Ce vaste projet (2019-2024) appuyant les recherches sur les écosystèmes de tourbières, de forêts et de lacs au Canada est financé par une Subvention à la découverte du CRSNG et le programme des Chaires de recherche du Canada. Parmi les collaborateurs clés, il faut souligner les personnes suivantes : Kurt Smemo (Collège Skidmore), Joe Yavitt (Université Cornell), Suzanna Bräuer (Université d’Appalachian State), Shaun Watmough (Université Trent), Erik Lilleskov et Jamie Lamit (Service des forêts des États-Unis), Andrew Tanentzap (Université Cambridge), Trevor Jones, Erik Emilson, Terri Porter, Caroline Emilson, Lisa Venier, Kara Webster et Paul Hazlett (Service canadien des forêts), Jim McLaughlin, Maara Packalen et Dave Morris (ministère des Richesses naturelles et des Forêts de l’Ontario), Brian Branfireun (Université Western), J. Ashley Scott, Corey Laamanen, John Gunn, Nadia Mykytczuk, Graeme Spiers, Peter Beckett, Pascale Roy-Léveillée et Daniel Campbell (Université Laurentienne).

Landscape Carbon Accumulation through Reductions in Emissions (L-CARE): developing reclamation protocols for carbon sequestration and habitat use.
Cette étude (2018-2021), financée par une subvention de recherche et développement du CRSNG et le programme ObjectifGES des Centres d’excellence de l’Ontario, vise à déterminer comment de grandes réductions des émissions de sulfure et de métaux dans le secteur minier de Sudbury, combinées à une nouvelle gestion des écosystèmes et des déchets miniers et aux pratiques de réhabilitation, conduiront à la séquestration de carbone et influenceront les processus sous-jacents de production primaire, de minéralisation et de transfert du carbone et de l’énergie dans les terres hautes, les terres humides et les écosystèmes des lacs. Nathan Basiliko (chercheur principal) avec John Gunn (collaborateur), Nadia Mykytczuk, Graeme Spiers, Peter Beckett (Laurentienne), John Smol et Andrew Paterson (Université Queen’s), J Michael Waddington (Université McMaster), Shaun Watmough (Université Trent), Paul del Giorgio et Yves Prairie (UQAM), JP Bellenger (Université de Sherbrooke), Joe Yavitt (Université Cornell), Andrew Tanentzap (Université Cambridge), Erik Emilson (Service canadien des forêts), Trevor Jones (ministère des Richesses naturelles et des Forêts de l’Ontario), et Brie Edwards (ministère de l’Environnement et de l’Action en matière de changement climatique). Nos partenaires sont Vale Canada, Sudbury Integrated Nickel Operations (une compagnie de Glencore), et la Ville du Grand Sudbury.

Enhancing Dewatering, Drying, Combustion and Utilization of Pulp and Paper Mill Biosludge.
Cette étude (2017-2020), financée par une subvention de recherche et développement du CRSNG, est menée par un grand consortium université-industrie à partir de la faculté de génie de l’Université de Toronto depuis le milieu des années 1980. Grant Allen est le chercheur principal, et les principaux dirigeants du groupe du programme en général sont Honghi Tran, Niko DiMartini, Grant, et Markus Bussmanm des départements de génie chimique et de chimie appliquée, et de génie mécanique de l’Université de Toronto. Le consortium s’intéresse entre autres aux défis qui se posent dans le secteur des pâtes et papiers au Canada et ailleurs, y compris à la récupération énergétique et chimique, à l’eau et à la réduction des déchets, aux nouvelles utilisations des résidus des usines (le principal rôle de mon groupe dans le consortium). Ce consortium de réputation internationale jouit du soutien continu du CRSNG et de plus de 50 partenaires industriels depuis sa création il y a 30 ans. Mon groupe examine comment les résidus minéraux (cendres des chaudières à biomasse, dépôts des chaudières de récupération, sable et boue de chaux) et organiques (boues des usines de traitement de l’eau et biosolides provenant des usines) peuvent être utilisés, modifiés et mélangés pour l’amendement du sol et la réhabilitation du territoire.

Prospecting for non-ore resources in Ontario’s mining sector.
Cette étude (2019-2021) est financée par le programme Bon pour l’innovation et la productivité II des Centres d’excellence de l’Ontario (Ashley Scott, chercheur principal, avec N. Basiliko et Corey Laamanen) des fonds du CRSNG et de Mitacs alloués à Ashley Scott et à moi. Elle repose sur le travail et l’expertise de M. Scott en matière de récupération de la chaleur et de l’énergie dégagées par les déchets dans le secteur minier de Sudbury pour la production industrielle de micro-algues et de nouveaux produits biologiques. L’étude (ainsi que les étudiants et d’autres collaborateurs) est présentée en détail sur le site http://www.ongen.ca.

Microbial consortia in mining waste rock: understanding microbial dynamics to optimize metal recovery, minimize metal migration and facilitate revegetation in cold environments.
Cette étude (2017-2020), dirigée par Susan Glasaur (Université de Guelph), avec Shaun Watmough (Université Trent) et Nadia Mykytczuk, Thomas Merritt et moi (Université Laurentienne), est financée par Environnement Canada. Mon groupe collabore avec Nadia et Shaun pour étudier les rôles des microbes dans l’écèse d’anciens déchets miniers ainsi que le rôle des amendements organiques dans la stimulation d’une communauté microbienne hétérotrophe semblable au sol.

Winter carbon losses in wetland ecosystem under current and future climates.
Ce projet (2019-2021), dirigé par Fereidoun Rezanezhad, avec Jon Price, Philippe Van Cappellen (Université de Waterloo), W. Quinton (Université Wilfred Laurier), Pascale Roy-Léveillée (Laurentienne) et moi, est financé par le Programme de soutien à l’avancement de la recherche sur les changements climatiques au Canada.

Enseignement
Je donne normalement les cours suivants à l’Université Laurentienne : BIOL 20206 EL Introduction to Microbiology, BIOL 3026 EL Applied and Environmental Microbiology et BIOL 4076 EL Ecosystem Ecology.